Lo stemma di Manduria è costituito da un mandorlo che emerge da un pozzo ubicato su di un manto erboso; ai lati dell'albero le lettere maiuscole: F ed M che sono le iniziali dei termini "Fons Mandurinum" (fonte mandurina). Questo stemma venne riconosciuto venne riconosciuto nel 1895 nell’ occasione in cui Manduria ebbe il titolo di città. Il pozzo raffigurato nello stemma è quello che sovrasta il lucernario naturale della volta della caverna del famoso "Fonte pliniano" una sorgente d'acqua che ancora oggi sgorga all'interno di una grotta sotterranea e che, per la legge dei vasi comunicanti, mantiene sempre lo stesso livello sia che si aggiunga sia che la si tolga dell’acqua. Questo fenomeno, inspiegabile ai tempi di Plinio il Vecchio, creava stupore e meraviglia.